眼科成立于1942年4月12日（附屬五官科），1979年獨立建科，經過幾代醫護人員的不懈努力，形成了技術精湛，專業齊全，設備先進。目前與多家醫院合作建立自治區人民醫院醫聯體，在全疆有著廣泛協作資源和平臺，具有較高聲譽和影響力，并與廣州中山眼科中心建立密切的學術合作，常年有國內頂尖眼科專家我科坐診、手術。

眼科由病房、門診、視光中心三部分組成，兩個病區84張床位，擁有一支理論基礎扎實，臨床經驗豐富，年齡結構合理，教學能力強的人才梯隊，醫護技人員共計52人，主任醫師5人，副主任醫師6人，主治醫師5人，住院醫師3人，其中碩士研究生導師2人,技師9人，護士22人，碩士研究生11人，在讀博士1人。有白內障、青光眼、眼底病、眼外傷、眼表疾病、屈光及眼肌、小兒眼科，眼眶整形、葡萄膜病、神經眼科等亞專業。2017年率先在全疆開展日間手術。年門、急診量達7萬余人，年均住院病人5000余人次，手術量5000余人次。

眼科設備齊全，現有進口ZESS,LEICA等手術顯微鏡4臺，以及配套齊全的顯微手術器械：美國最先進的BAUSCH+LOMB、ALCON公司生產的玻璃體切割儀；美國BAUSCH+LOMB、ALCON公司的白內障超聲乳化機、氬激光、YAG激光治療機；半導體激光儀；歐堡超廣角眼底照相儀、TOPCON眼底熒光造影、吲哚青綠造影儀；眼電生理檢查儀；HUMPHREY-11型自動視野； TOPCON3DOCT-1000;TOPCON非接觸眼壓計；同視機；TOPCON電腦驗光儀等全套先進診療儀器。

我科臨床開展診治項目包括各種眼科常見病及眼科疑難病。在飛秒激光近視手術、白內障超聲乳化、復雜眼底病、復雜眼外傷、疑難青光眼、角膜移植手術等領域尤有特長。特別是眼后段玻璃體視網膜手術，復雜青光眼引流釘，引流閥手術，由波前像差儀引導的準分子激光手術；復雜白內障（先天性白內障，外傷性白內障，小瞳孔下行白內障摘除術等）的手術治療，術后療效顯著。另外眼部腫瘤及各種眼外傷的治療、眼病激光治療，眼前段疾病的激光治療，新生兒視網膜病變的篩查；角膜移植手術；眼肌病的診治及手術治療；干眼病篩查、診斷與治療等也是本科的特色。我科醫療服務質量優質可信。

眼科是自治區防盲辦公室掛靠單位，是連續29年的主委單位，自治區重點?？?，住院醫師規范化培訓和考試基地，是安徽醫科大學、新疆醫科大學、石河子醫科大學教學醫院，健康快車新疆白內障顯微手術培訓中心，設有專用的動物實驗室。

2018年區醫視光中心成立，采用最先進的電子健康檔案管理，提供全面的醫學驗光配鏡，兒童近視防控，角膜塑形鏡驗配，斜弱視治療等綜合眼視光服務，2020年引進世界最先進的蔡司SMILE3.0全飛秒設備，開啟全面眼健康管理模式。